疫情初期，很多厂家的试剂一研发出来就投入市场，没有做足够的性能验证试验，出现了质量参差不齐的情况。因此，核酸检测结果也出现了偏差。
假阳性/假阴性除了与试剂盒质量有关，还与标本及时正确采集息息相关。如果标本采集错误、标本存放时间过长（病毒核酸降解）等都会造成假阴性。
CT影像与核酸检测应相互辅助
筛选新冠病毒感染，选择胸部CT还是核酸检测？武汉同济医院最近对1014例感染者进行回顾性研究发现，核酸检测敏感性性差、特异性好、容易漏诊；胸部CT敏感性好，特异性差，容易误诊。
为什么CT检测与核酸测定的数据结果会有一定差异性？武汉大学中南医院医学影像科主任徐海波表示，“这是临床所采用的不同的两种标准。病毒核酸检测结果显阳性，是病理或病原学作为检测标准。实际在临床过程中，应该有80％或90％的比例，都采用的是临床诊断病例这种方式进行诊断的”。
诊断一个疾病，从来都是需要医生综合分析，特别是对于广大基层医院，单纯依靠影像学或病原学证据发现新冠病毒肺炎，十分困难。以武汉为例，因为前期患者较多，单凭核酸检测容易漏诊，CT筛查就更具优势，可尽早发现患者、尽早隔离。
而在湖北以外的地区，如青海、甘肃、宁夏等患者较少的地区，门诊常规进行胸部CT检查是否妥当，需要商榷，进一步研究。专家认为，核算检测敏感性低，但没有辐射，特异性好，若能普及，可能更为妥当。
张笑春后来在接受媒体采访时也表示，发文并非否定核酸检测结果，而是认为其作为检测最终手段，在当初受到产量、采样方式的限制，在武汉无法达到切断传染源的防控效果。不过，他认为，这个建议只适合灾区，不适合普通、散发病例筛查。普通的散病筛查要做到鉴别诊断，而CT不能做到鉴别诊断。
